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原文链接:https://databricks.com/blog/2019/06/26/scaling-genomic-workflows-with-spark-sql-bgen-and-vcf-readers.html

作者: Ali-genomics 818人浏览

本文主要介绍咋样在ACK上基于工作流引擎进行大规模基因测序工作。阿里云工作流引擎基于开源项目Argo实现,支持并发、循环、重试等多种执行策略。

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作者: 新燕刀 1045人浏览

专项阿里云基因组学行业标签

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作者: Ali-genomics 589人浏览

一家大型基因测序功能公司每日会产生 10TB 到 400TB 的下机数据,大数据生信分析平台需用达到 PB 级别的数据正确处理能力。这眼前 是生物科技和计算机科技的双向支撑:测序应用从科研逐步走向临床应用,计算模式从离线向在线演进,交付带宽这麼 重要。

阿里云E-HPC(弹性高性能计算)在最近的发布中支持多队列调度以及管理,另外发布针对多队列调度自动伸缩的策略支持。

作者: 新燕刀 516人浏览

专项阿里云基因组学行业标签

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随着测序技术的不断发展,血块基因组学数据被积累,对于数据分析软件的要求也这麼 高,尤其是在做基因组组装分析时,软件的计算资料消耗和分析周期往往是研究者不得不考虑的大什么的问题。Canu[1]是一款目前广泛使用的三代基因组组装软件,文章发表短短两年时间,引用的次数已接近4000次,其中不乏顶级的CNS期刊。

作者: 新燕刀 692人浏览